59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1218 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  100 
 
 
938 aa  1767    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  48.48 
 
 
877 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  43.77 
 
 
870 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  41.47 
 
 
883 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  55.78 
 
 
959 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  51.23 
 
 
889 aa  357  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  35.36 
 
 
1041 aa  327  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  33.91 
 
 
1036 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  76.84 
 
 
885 aa  298  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  76.32 
 
 
918 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  53.73 
 
 
870 aa  240  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  38.17 
 
 
952 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  63.53 
 
 
964 aa  201  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  59.06 
 
 
933 aa  187  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  37.53 
 
 
940 aa  184  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  35.62 
 
 
1027 aa  177  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  38.42 
 
 
828 aa  172  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 
969 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  34.15 
 
 
968 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  33.73 
 
 
962 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  37.55 
 
 
673 aa  140  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.92 
 
 
914 aa  140  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  29.06 
 
 
946 aa  136  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  28.72 
 
 
927 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  27.89 
 
 
924 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  31.54 
 
 
1057 aa  129  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  29.59 
 
 
888 aa  128  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  38.11 
 
 
679 aa  127  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  30.87 
 
 
1245 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  28.15 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  31.74 
 
 
819 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  31.52 
 
 
658 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  31.62 
 
 
826 aa  108  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.34 
 
 
806 aa  108  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  29.28 
 
 
640 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  25.64 
 
 
897 aa  101  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  29.17 
 
 
681 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  27.24 
 
 
683 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  27.76 
 
 
822 aa  87.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  30.71 
 
 
692 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.59 
 
 
458 aa  86.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  35.03 
 
 
595 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.55 
 
 
744 aa  82  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  39.64 
 
 
948 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.62 
 
 
472 aa  74.3  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 
883 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  32.86 
 
 
640 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  36.22 
 
 
717 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  35.25 
 
 
737 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.74 
 
 
731 aa  68.2  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  26.69 
 
 
722 aa  65.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  24.44 
 
 
715 aa  65.1  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 
911 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  26.35 
 
 
896 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  31.36 
 
 
911 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  31.36 
 
 
912 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  28.04 
 
 
931 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  43.64 
 
 
392 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0918  putative type 4 pilus biogenesis  33.03 
 
 
601 aa  44.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>