54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1052 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  70 
 
 		 458 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  100 
 
 		 472 aa  959    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 		 940 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  27.96 
 
 		 1027 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  31.17 
 
 		 826 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 		 952 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  30.7 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  34.64 
 
 		 938 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  30.94 
 
 		 962 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  30.26 
 
 		 640 aa  73.2  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  27.69 
 
 		 806 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  32.35 
 
 		 885 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  29.83 
 
 		 969 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  32.34 
 
 		 918 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  29.83 
 
 		 968 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  48.75 
 
 		 658 aa  70.5  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1041 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 911 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  28 
 
 		 822 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  30.45 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  31.28 
 
 		 889 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  35.39 
 
 		 959 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  33.53 
 
 		 933 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1036 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  28.85 
 
 		 1057 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  30.05 
 
 		 870 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  25.07 
 
 		 924 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  48.21 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  26.32 
 
 		 883 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  22.74 
 
 		 819 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  27.65 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  29.55 
 
 		 912 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  30.11 
 
 		 964 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  25.07 
 
 		 927 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.14 
 
 		 931 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.39 
 
 		 914 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  30.3 
 
 		 828 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 870 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  40.28 
 
 		 883 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  22.69 
 
 		 888 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  25 
 
 		 679 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  29.37 
 
 		 877 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  22.42 
 
 		 279 aa  50.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.64 
 
 		 731 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  31.25 
 
 		 897 aa  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  25.64 
 
 		 722 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  45.16 
 
 		 241 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  37.93 
 
 		 1245 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  31.54 
 
 		 948 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  29.53 
 
 		 947 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  43.1 
 
 		 890 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  26.52 
 
 		 717 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  33.07 
 
 		 737 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>