103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1661 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  85.71 
 
 		 947 aa  1338    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 948 aa  1836    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  45.13 
 
 		 911 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  45.66 
 
 		 911 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  46.04 
 
 		 896 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  55.32 
 
 		 883 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  40.49 
 
 		 946 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  53.07 
 
 		 924 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  55.03 
 
 		 927 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  58.95 
 
 		 931 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  56.2 
 
 		 912 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  32.82 
 
 		 1245 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  38.86 
 
 		 1057 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1041 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 888 aa  197  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  37.53 
 
 		 914 aa  196  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1036 aa  188  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.07 
 
 		 744 aa  168  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  37.75 
 
 		 681 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  43.39 
 
 		 692 aa  164  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  44.4 
 
 		 717 aa  159  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  33.25 
 
 		 819 aa  151  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  42.45 
 
 		 737 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  30.48 
 
 		 806 aa  149  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  33.5 
 
 		 640 aa  148  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  39.52 
 
 		 683 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  33.25 
 
 		 640 aa  146  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  30.16 
 
 		 877 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  32.28 
 
 		 658 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  33.42 
 
 		 889 aa  133  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  31.16 
 
 		 897 aa  132  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  32.61 
 
 		 828 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  31.23 
 
 		 1027 aa  127  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  31.39 
 
 		 952 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  32.32 
 
 		 969 aa  127  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  40.86 
 
 		 595 aa  126  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  34.76 
 
 		 679 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  31.22 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  31.65 
 
 		 959 aa  122  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  32.64 
 
 		 938 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  30.16 
 
 		 870 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  27.86 
 
 		 822 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  32.57 
 
 		 673 aa  107  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  28.57 
 
 		 279 aa  90.1  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  28.34 
 
 		 715 aa  85.9  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30.19 
 
 		 731 aa  84  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  27.38 
 
 		 945 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 964 aa  80.5  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  30.15 
 
 		 722 aa  80.9  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  38.53 
 
 		 870 aa  75.1  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 940 aa  74.7  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  38.53 
 
 		 883 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1273 aa  68.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  29.2 
 
 		 1454 aa  68.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  40.19 
 
 		 1482 aa  68.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  44.78 
 
 		 1247 aa  65.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  25.35 
 
 		 895 aa  65.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  38.74 
 
 		 937 aa  65.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1097 aa  64.3  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  35.56 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1162 aa  60.1  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  36.47 
 
 		 1359 aa  59.7  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  28.75 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  48.33 
 
 		 1621 aa  58.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1147 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  30 
 
 		 604 aa  58.2  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  26.15 
 
 		 957 aa  58.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  23.31 
 
 		 1408 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1143 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1148 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  37.5 
 
 		 1761 aa  57  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1149 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1135 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1110 aa  56.2  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  26.67 
 
 		 601 aa  55.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1566  hypothetical protein  40.35 
 
 		 539 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1115 aa  52  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  38.98 
 
 		 312 aa  51.6  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  38.98 
 
 		 312 aa  51.6  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1124 aa  51.6  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1129 aa  51.2  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  40.38 
 
 		 323 aa  50.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  32.79 
 
 		 890 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  47.06 
 
 		 885 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1406  hypothetical protein  38.6 
 
 		 531 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.155703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  45.45 
 
 		 392 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  48.94 
 
 		 882 aa  49.3  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.29 
 
 		 336 aa  47.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.15 
 
 		 458 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.54 
 
 		 472 aa  47.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  46.81 
 
 		 752 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  46.81 
 
 		 783 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  39.22 
 
 		 962 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  46.81 
 
 		 802 aa  46.2  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  44.68 
 
 		 694 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1929  hypothetical protein  37.5 
 
 		 372 aa  46.2  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000777643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  44.68 
 
 		 685 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  47.73 
 
 		 826 aa  45.8  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  44.68 
 
 		 708 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  44.68 
 
 		 708 aa  45.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>