72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2151 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  100 
 
 		 937 aa  1814    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  43.82 
 
 		 945 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1135 aa  366  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1147 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  39.88 
 
 		 1149 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  39.67 
 
 		 1143 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1124 aa  352  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  39.7 
 
 		 1148 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  41.44 
 
 		 1115 aa  346  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  39.25 
 
 		 1097 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  40.9 
 
 		 957 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1110 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  36.32 
 
 		 1408 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  42.88 
 
 		 895 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  35.74 
 
 		 1761 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  63.89 
 
 		 1129 aa  171  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1482 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1162 aa  105  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  28.57 
 
 		 1359 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1273 aa  99.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  29.44 
 
 		 1454 aa  97.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1621 aa  90.1  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  40.38 
 
 		 1057 aa  88.6  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  33.62 
 
 		 822 aa  84  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  33.33 
 
 		 1247 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  25.6 
 
 		 897 aa  78.2  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  24.75 
 
 		 1245 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  31.25 
 
 		 927 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  33.59 
 
 		 888 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  31.16 
 
 		 924 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  28.92 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  36.79 
 
 		 948 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  36.79 
 
 		 947 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  36.52 
 
 		 883 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.79 
 
 		 914 aa  62.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  37.84 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  39.02 
 
 		 931 aa  62  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  30.73 
 
 		 896 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  41.33 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  27.91 
 
 		 911 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  41.33 
 
 		 384 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  27.91 
 
 		 911 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  23.76 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  40 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  33.62 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  33.66 
 
 		 819 aa  55.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.78 
 
 		 731 aa  55.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  34.78 
 
 		 722 aa  55.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  46.03 
 
 		 392 aa  55.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  25.79 
 
 		 640 aa  53.5  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  26.77 
 
 		 640 aa  53.5  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  27.91 
 
 		 912 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  31.25 
 
 		 364 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  46.03 
 
 		 312 aa  52.4  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  46.03 
 
 		 312 aa  52.4  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  32.03 
 
 		 364 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  45.45 
 
 		 349 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  45.45 
 
 		 349 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  39.24 
 
 		 345 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  33.64 
 
 		 826 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1041 aa  48.5  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  32.79 
 
 		 679 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  29.67 
 
 		 806 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  34.41 
 
 		 870 aa  47.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  36.92 
 
 		 883 aa  47  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  28.9 
 
 		 952 aa  46.2  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1036 aa  45.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  37.29 
 
 		 300 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  37.84 
 
 		 959 aa  44.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  31.88 
 
 		 241 aa  44.3  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 		 940 aa  44.3  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>