69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2985 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  100 
 
 		 1135 aa  2160    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  49.17 
 
 		 945 aa  549  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  42.14 
 
 		 1129 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  42.89 
 
 		 1124 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  42.35 
 
 		 1115 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  40.46 
 
 		 1097 aa  406  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1110 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  42.53 
 
 		 937 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  47.6 
 
 		 895 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  36.35 
 
 		 1408 aa  365  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  39.22 
 
 		 957 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  36.92 
 
 		 1761 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  65.71 
 
 		 1143 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  65.71 
 
 		 1147 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  65.71 
 
 		 1149 aa  181  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  65.71 
 
 		 1148 aa  181  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1162 aa  108  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  28.08 
 
 		 1359 aa  106  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1482 aa  105  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  26.67 
 
 		 1454 aa  96.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1621 aa  91.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  48.05 
 
 		 1057 aa  83.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1273 aa  80.1  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  32.03 
 
 		 1247 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  30.34 
 
 		 822 aa  78.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.69 
 
 		 914 aa  75.5  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  24.14 
 
 		 897 aa  72  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  27.23 
 
 		 888 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  36.04 
 
 		 927 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  34.91 
 
 		 924 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.63 
 
 		 806 aa  63.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  40.62 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  41.27 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  32.98 
 
 		 946 aa  60.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.82 
 
 		 336 aa  60.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  32.22 
 
 		 947 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  42.86 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  40 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  25.12 
 
 		 911 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  35.58 
 
 		 828 aa  57.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  25.12 
 
 		 911 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  32.73 
 
 		 883 aa  57  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  26.16 
 
 		 948 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.33 
 
 		 744 aa  56.2  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  46.03 
 
 		 392 aa  54.3  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  31.78 
 
 		 819 aa  54.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30 
 
 		 931 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 870 aa  53.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  38.98 
 
 		 345 aa  52.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  40.35 
 
 		 364 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  40.35 
 
 		 349 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  40.35 
 
 		 364 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  40.35 
 
 		 349 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  37.68 
 
 		 883 aa  51.6  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  25.12 
 
 		 912 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  37.7 
 
 		 300 aa  49.3  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  32.14 
 
 		 826 aa  48.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  32.18 
 
 		 279 aa  48.5  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  40.58 
 
 		 889 aa  48.5  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 885 aa  48.1  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  34.55 
 
 		 681 aa  48.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  27.19 
 
 		 1027 aa  47.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 918 aa  47.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  48.94 
 
 		 312 aa  46.2  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  48.94 
 
 		 312 aa  46.2  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1036 aa  45.8  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  39.39 
 
 		 959 aa  46.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  33.9 
 
 		 241 aa  45.8  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1041 aa  45.1  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>