61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5240 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  100 
 
 		 964 aa  1871    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  46.07 
 
 		 877 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  44.54 
 
 		 870 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  58.65 
 
 		 918 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  58.65 
 
 		 885 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  53.58 
 
 		 959 aa  351  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  56.58 
 
 		 938 aa  340  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1036 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1041 aa  312  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  46.65 
 
 		 933 aa  289  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  39.44 
 
 		 952 aa  227  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  38.42 
 
 		 962 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  37.56 
 
 		 968 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  37.95 
 
 		 940 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  26.45 
 
 		 946 aa  156  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  32.73 
 
 		 927 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.86 
 
 		 914 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  31.43 
 
 		 924 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  32.22 
 
 		 279 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  32.29 
 
 		 1245 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  35.32 
 
 		 673 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  32.03 
 
 		 1057 aa  127  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  53.21 
 
 		 883 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  28.91 
 
 		 897 aa  121  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  51.82 
 
 		 870 aa  121  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  29.43 
 
 		 888 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  35.77 
 
 		 658 aa  118  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.09 
 
 		 931 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  36.13 
 
 		 679 aa  116  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  29.9 
 
 		 640 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  31.6 
 
 		 819 aa  116  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 826 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  30.71 
 
 		 640 aa  107  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  28.12 
 
 		 883 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  38.04 
 
 		 828 aa  104  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  28.21 
 
 		 896 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  29.59 
 
 		 947 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  29.3 
 
 		 806 aa  100  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  26.84 
 
 		 911 aa  99  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  28.41 
 
 		 911 aa  98.2  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  27.37 
 
 		 912 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  28.94 
 
 		 822 aa  90.9  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  28.69 
 
 		 692 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  26.4 
 
 		 681 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  60.53 
 
 		 889 aa  80.9  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  30.56 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  35.4 
 
 		 948 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.1 
 
 		 744 aa  75.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  28.11 
 
 		 737 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  32.86 
 
 		 595 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  39.56 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  39.56 
 
 		 722 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  26.27 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.52 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  23.5 
 
 		 715 aa  63.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  28.72 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  33.58 
 
 		 633 aa  56.2  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0918  putative type 4 pilus biogenesis  37.61 
 
 		 601 aa  47.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  39.44 
 
 		 542 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  27.54 
 
 		 895 aa  45.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  44 
 
 		 392 aa  44.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>