89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2309 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 952 aa  1877    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  70.66 
 
 		 940 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  54.09 
 
 		 968 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  54.24 
 
 		 962 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  54.5 
 
 		 969 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  37.47 
 
 		 1036 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1041 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  39.74 
 
 		 889 aa  232  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  47.16 
 
 		 673 aa  227  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  38.69 
 
 		 918 aa  215  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  38.68 
 
 		 885 aa  213  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  35.29 
 
 		 1027 aa  206  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  36.82 
 
 		 959 aa  205  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  37.87 
 
 		 938 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  38.44 
 
 		 870 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  38.71 
 
 		 828 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  34.85 
 
 		 883 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  28.61 
 
 		 946 aa  172  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  29.15 
 
 		 1057 aa  163  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  27.04 
 
 		 1245 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30.51 
 
 		 914 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  31.4 
 
 		 927 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  30.81 
 
 		 924 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  41.92 
 
 		 877 aa  153  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  35.51 
 
 		 279 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  33.92 
 
 		 819 aa  140  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 911 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  30.31 
 
 		 911 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  30.5 
 
 		 640 aa  131  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  30.73 
 
 		 640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  31.28 
 
 		 896 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  46.21 
 
 		 964 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  28.89 
 
 		 888 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  28.06 
 
 		 897 aa  124  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  28.79 
 
 		 912 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  31.47 
 
 		 658 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  30.24 
 
 		 806 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  34.13 
 
 		 679 aa  111  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  42.03 
 
 		 933 aa  108  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  44.95 
 
 		 870 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  31.23 
 
 		 826 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  30.54 
 
 		 822 aa  100  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  30.15 
 
 		 715 aa  95.5  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  28.01 
 
 		 681 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  24.4 
 
 		 744 aa  84.3  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  27.59 
 
 		 731 aa  84  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.52 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  38.26 
 
 		 883 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.7 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  29.67 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  27.3 
 
 		 722 aa  79  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  37.5 
 
 		 948 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  35.65 
 
 		 947 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 		 737 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  28.62 
 
 		 683 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  33.12 
 
 		 595 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  28.34 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  30.77 
 
 		 633 aa  53.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  45.45 
 
 		 931 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  47.62 
 
 		 1454 aa  51.2  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1482 aa  50.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  47.27 
 
 		 1761 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  57.5 
 
 		 783 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  34.78 
 
 		 708 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  34.78 
 
 		 708 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  34.78 
 
 		 710 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  30.35 
 
 		 6272 aa  48.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  28.8 
 
 		 895 aa  47.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  50 
 
 		 882 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  44.3 
 
 		 957 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  48.84 
 
 		 844 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  34.78 
 
 		 802 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  48.84 
 
 		 875 aa  47  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  48.84 
 
 		 875 aa  47  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  48.84 
 
 		 881 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  48.84 
 
 		 882 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  48.84 
 
 		 875 aa  47  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  48.84 
 
 		 881 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  47.92 
 
 		 890 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  35.97 
 
 		 1056 aa  46.2  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1162 aa  45.8  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  48.84 
 
 		 685 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  42.11 
 
 		 392 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  45.83 
 
 		 752 aa  45.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  48.84 
 
 		 694 aa  45.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  50 
 
 		 1359 aa  45.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1214  hypothetical protein  27.27 
 
 		 610 aa  45.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1273 aa  44.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  34.67 
 
 		 945 aa  44.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>