63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2589 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  98.64 
 
 		 918 aa  1690    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  100 
 
 		 885 aa  1716    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  47.71 
 
 		 877 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  47.32 
 
 		 870 aa  473  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  52 
 
 		 889 aa  340  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1041 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1036 aa  313  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  47.59 
 
 		 933 aa  300  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  72.41 
 
 		 938 aa  296  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  44.23 
 
 		 883 aa  280  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  37.94 
 
 		 952 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  59.76 
 
 		 964 aa  199  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  33.59 
 
 		 962 aa  188  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  28.35 
 
 		 1245 aa  158  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.13 
 
 		 914 aa  156  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  31.59 
 
 		 924 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  29.93 
 
 		 927 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  27.69 
 
 		 946 aa  145  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  30.22 
 
 		 1057 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.96 
 
 		 931 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  53.97 
 
 		 1027 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  27.57 
 
 		 888 aa  124  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  32.81 
 
 		 826 aa  121  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  31 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  37.63 
 
 		 828 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  32.13 
 
 		 679 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  40.25 
 
 		 968 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  28.65 
 
 		 883 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  32.09 
 
 		 640 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.22 
 
 		 806 aa  118  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  30.51 
 
 		 640 aa  117  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  29.47 
 
 		 897 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  42.58 
 
 		 673 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  40.3 
 
 		 969 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  29.57 
 
 		 896 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  29.57 
 
 		 911 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  33.83 
 
 		 658 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  29.28 
 
 		 911 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  39.86 
 
 		 940 aa  108  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  32.43 
 
 		 947 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  29.08 
 
 		 681 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  29.15 
 
 		 822 aa  95.5  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.87 
 
 		 744 aa  93.6  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  28.94 
 
 		 912 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  29.96 
 
 		 692 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  27.57 
 
 		 683 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  55.32 
 
 		 959 aa  84  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  34.07 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  36.63 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  31.64 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  28.05 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.35 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  41.49 
 
 		 870 aa  67.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  23.6 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.78 
 
 		 731 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  27.11 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  34.41 
 
 		 819 aa  56.6  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  28.91 
 
 		 598 aa  55.1  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  47.06 
 
 		 948 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  31.82 
 
 		 1359 aa  51.2  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1135 aa  48.9  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  26.11 
 
 		 307 aa  45.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  46.15 
 
 		 392 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>