80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2853 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1315    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  47.76 
 
 		 658 aa  425  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  50.1 
 
 		 640 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  49.13 
 
 		 640 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.33 
 
 		 914 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  34.1 
 
 		 819 aa  154  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  34.86 
 
 		 946 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  35.31 
 
 		 1245 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  35 
 
 		 888 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1041 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  35.46 
 
 		 959 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1036 aa  135  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  33.42 
 
 		 889 aa  132  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  35.19 
 
 		 1027 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  34 
 
 		 828 aa  130  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  30.98 
 
 		 927 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  32.63 
 
 		 948 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  30.96 
 
 		 924 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 911 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  32.8 
 
 		 918 aa  127  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.8 
 
 		 931 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  33.08 
 
 		 1057 aa  127  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  31.99 
 
 		 911 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  32.84 
 
 		 279 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  32.53 
 
 		 885 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  32.26 
 
 		 912 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  30.05 
 
 		 883 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  31.58 
 
 		 806 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  31.73 
 
 		 896 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  29.37 
 
 		 962 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  24.9 
 
 		 897 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  32.61 
 
 		 969 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  32.62 
 
 		 968 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  30.12 
 
 		 952 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 938 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  36.76 
 
 		 673 aa  110  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  31.6 
 
 		 822 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  36.25 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  32.26 
 
 		 870 aa  105  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.86 
 
 		 731 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  29.7 
 
 		 940 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  32.86 
 
 		 722 aa  103  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.53 
 
 		 744 aa  97.8  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  32.3 
 
 		 715 aa  94.4  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  29.37 
 
 		 681 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  30.37 
 
 		 826 aa  85.1  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  38.52 
 
 		 933 aa  82  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  40.18 
 
 		 947 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  41.53 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.4 
 
 		 458 aa  73.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  40 
 
 		 870 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  29.41 
 
 		 683 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  30.83 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  38.78 
 
 		 883 aa  70.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.59 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  31.08 
 
 		 737 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  26.94 
 
 		 945 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  29.03 
 
 		 604 aa  58.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  26.91 
 
 		 937 aa  53.9  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  38.81 
 
 		 1247 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 964 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1162 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  42.62 
 
 		 392 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  31.91 
 
 		 1359 aa  51.2  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1482 aa  50.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  29.77 
 
 		 601 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  32.58 
 
 		 386 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  27.37 
 
 		 1454 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1115 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  25.65 
 
 		 598 aa  47.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1110 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1135 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  44.93 
 
 		 802 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1124 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1129 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  40 
 
 		 783 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1273 aa  45.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1097 aa  44.3  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  32.63 
 
 		 345 aa  44.3  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>