17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3369 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 598 aa  1210    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1214  hypothetical protein  29.91 
 
 		 610 aa  133  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0918  putative type 4 pilus biogenesis  38.78 
 
 		 601 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1948  hypothetical protein  34.01 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  26.26 
 
 		 1027 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  25.81 
 
 		 918 aa  54.7  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  30.08 
 
 		 933 aa  53.9  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  25.52 
 
 		 885 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2508  hypothetical protein  28.12 
 
 		 631 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  28.24 
 
 		 826 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3289  hypothetical protein  32.41 
 
 		 917 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0563136  normal  0.27201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 870 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  30.37 
 
 		 889 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  30.08 
 
 		 962 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  25.9 
 
 		 927 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  29.79 
 
 		 877 aa  44.3  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  24.78 
 
 		 924 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>