75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1339 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  100 
 
 		 826 aa  1590    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.87 
 
 		 914 aa  155  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  31.36 
 
 		 1027 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30.32 
 
 		 931 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  34.64 
 
 		 806 aa  130  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  30.22 
 
 		 946 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  29.41 
 
 		 927 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  30.91 
 
 		 924 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  33.2 
 
 		 888 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  30.51 
 
 		 885 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  33.82 
 
 		 1057 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  27.05 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  31.92 
 
 		 819 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  33.21 
 
 		 962 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  30.18 
 
 		 1245 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1041 aa  107  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1036 aa  106  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  30.91 
 
 		 938 aa  103  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  31.51 
 
 		 883 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  32.02 
 
 		 911 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  32.02 
 
 		 911 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  32.13 
 
 		 959 aa  100  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  27.99 
 
 		 912 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  30.47 
 
 		 968 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  27.32 
 
 		 896 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  28.64 
 
 		 822 aa  94.7  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  33.05 
 
 		 681 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  27.24 
 
 		 897 aa  90.9  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  32.5 
 
 		 658 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  30.65 
 
 		 889 aa  88.6  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  32.39 
 
 		 717 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  30.2 
 
 		 673 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  27.24 
 
 		 877 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  27.91 
 
 		 870 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.67 
 
 		 744 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  26.22 
 
 		 279 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.17 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  30.92 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  32.39 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  27.43 
 
 		 945 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  25.66 
 
 		 828 aa  77.4  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  31.37 
 
 		 679 aa  75.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  32.31 
 
 		 683 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30.33 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  36.51 
 
 		 940 aa  71.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  34.88 
 
 		 933 aa  70.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  30.74 
 
 		 870 aa  68.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  32.48 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  32.12 
 
 		 969 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  39.51 
 
 		 947 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  28.52 
 
 		 640 aa  63.9  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  27.48 
 
 		 937 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  33.59 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.3 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  26.12 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  26.58 
 
 		 957 aa  60.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  30.35 
 
 		 883 aa  60.1  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  42.68 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  28.78 
 
 		 895 aa  57.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  41.1 
 
 		 964 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  30.08 
 
 		 640 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1135 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  34.74 
 
 		 364 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  39.19 
 
 		 364 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  39.44 
 
 		 349 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  39.44 
 
 		 349 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  35.63 
 
 		 1247 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 		 598 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  47.73 
 
 		 948 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  24 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  35.44 
 
 		 604 aa  46.2  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1097 aa  45.8  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0759  Peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 577 aa  44.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.830625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  53.85 
 
 		 1359 aa  44.3  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>