58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2160 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  100 
 
 		 870 aa  1656    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  41.39 
 
 		 877 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  58.35 
 
 		 883 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1036 aa  357  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1041 aa  326  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  44.04 
 
 		 959 aa  266  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  39.44 
 
 		 952 aa  234  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  39.81 
 
 		 962 aa  231  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  41.12 
 
 		 969 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  64.67 
 
 		 938 aa  222  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  39.32 
 
 		 968 aa  218  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  39.8 
 
 		 940 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  35.14 
 
 		 1027 aa  211  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  60.13 
 
 		 870 aa  190  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  36.92 
 
 		 828 aa  181  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  56.29 
 
 		 889 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  51.15 
 
 		 933 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  35.74 
 
 		 279 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  35.53 
 
 		 673 aa  153  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  29.98 
 
 		 927 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  30 
 
 		 924 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  49.61 
 
 		 964 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  33.95 
 
 		 819 aa  129  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  29.22 
 
 		 1057 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  28.16 
 
 		 888 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  27.88 
 
 		 806 aa  121  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  31.18 
 
 		 826 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  30.98 
 
 		 640 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  29.39 
 
 		 1245 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  29.7 
 
 		 640 aa  111  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  34.5 
 
 		 679 aa  107  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  28.68 
 
 		 681 aa  104  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  31.61 
 
 		 658 aa  101  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  25.26 
 
 		 897 aa  98.2  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  40.98 
 
 		 914 aa  94.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  31.07 
 
 		 683 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  28.04 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  35.71 
 
 		 595 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  32.38 
 
 		 911 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  39.64 
 
 		 948 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  28.46 
 
 		 692 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  37.27 
 
 		 883 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  29.27 
 
 		 896 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.69 
 
 		 731 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  26.69 
 
 		 722 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.2 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  32.95 
 
 		 911 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  36.94 
 
 		 947 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  29.76 
 
 		 912 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 		 737 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  32.79 
 
 		 717 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  31.86 
 
 		 822 aa  66.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  29.79 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  58 
 
 		 918 aa  60.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  58 
 
 		 885 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  41.46 
 
 		 895 aa  58.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  48.15 
 
 		 392 aa  45.8  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  37.4 
 
 		 412 aa  45.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>