66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4871 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  100 
 
 		 959 aa  1853    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  47.51 
 
 		 877 aa  475  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  44.28 
 
 		 870 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  56.3 
 
 		 918 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  55.8 
 
 		 885 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  51.71 
 
 		 889 aa  340  9e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  53.85 
 
 		 938 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1041 aa  319  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  34.33 
 
 		 1036 aa  304  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  36.32 
 
 		 952 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  35.82 
 
 		 962 aa  191  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  43.77 
 
 		 883 aa  181  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  56.74 
 
 		 964 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  55.36 
 
 		 933 aa  168  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  32.52 
 
 		 828 aa  160  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.85 
 
 		 914 aa  154  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  39.49 
 
 		 940 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  31.82 
 
 		 927 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  47.59 
 
 		 870 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  31.82 
 
 		 924 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  31.25 
 
 		 946 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  29.47 
 
 		 883 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  35.74 
 
 		 279 aa  125  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  35.86 
 
 		 673 aa  125  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  32.9 
 
 		 640 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  48.84 
 
 		 1027 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  39.5 
 
 		 679 aa  121  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  26.88 
 
 		 888 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  32.57 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  32.6 
 
 		 1057 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  28.65 
 
 		 911 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  34.07 
 
 		 658 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  31.47 
 
 		 911 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  33.33 
 
 		 1245 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.27 
 
 		 931 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  28.21 
 
 		 897 aa  111  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  34.13 
 
 		 826 aa  107  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  30.21 
 
 		 947 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.34 
 
 		 806 aa  107  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  28.36 
 
 		 912 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  33.61 
 
 		 681 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  27.87 
 
 		 744 aa  94.7  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  35.27 
 
 		 692 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  33.74 
 
 		 683 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  36.88 
 
 		 595 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  26.89 
 
 		 822 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  30.74 
 
 		 737 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  31.14 
 
 		 717 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  33.63 
 
 		 948 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.65 
 
 		 731 aa  72.8  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  32.65 
 
 		 722 aa  72.8  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.81 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  25.5 
 
 		 715 aa  68.2  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.41 
 
 		 472 aa  67  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3812  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  67.74 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.458595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  32.18 
 
 		 819 aa  51.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  30.62 
 
 		 598 aa  46.2  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  40.24 
 
 		 708 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  40.24 
 
 		 710 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  40.24 
 
 		 708 aa  45.8  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  52.08 
 
 		 340 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  36.36 
 
 		 895 aa  45.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  37.84 
 
 		 937 aa  45.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  36.67 
 
 		 971 aa  45.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  37.33 
 
 		 957 aa  44.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2907  hypothetical protein  43.04 
 
 		 625 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>