60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3043 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  100 
 
 		 870 aa  1697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  48.92 
 
 		 877 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  53.32 
 
 		 889 aa  355  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1041 aa  287  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  46.38 
 
 		 918 aa  282  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  45.05 
 
 		 959 aa  260  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  42.16 
 
 		 938 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  41.03 
 
 		 870 aa  237  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  42.52 
 
 		 883 aa  233  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  56.74 
 
 		 933 aa  198  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  62.34 
 
 		 885 aa  195  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  36.62 
 
 		 952 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  38.65 
 
 		 1027 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  34.92 
 
 		 962 aa  154  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  53.05 
 
 		 964 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 968 aa  151  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  46.63 
 
 		 1036 aa  137  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  32.46 
 
 		 279 aa  126  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  30.91 
 
 		 927 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  33.1 
 
 		 819 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.21 
 
 		 914 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  30.67 
 
 		 924 aa  118  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  27.46 
 
 		 888 aa  108  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  27.37 
 
 		 946 aa  106  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  37.73 
 
 		 673 aa  105  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  32.01 
 
 		 658 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  26.5 
 
 		 897 aa  99  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  37.09 
 
 		 940 aa  96.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  27.04 
 
 		 640 aa  94.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  26.9 
 
 		 640 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 		 1057 aa  93.2  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  32.93 
 
 		 679 aa  93.2  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  27.03 
 
 		 883 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  26.54 
 
 		 911 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  36.75 
 
 		 828 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  27.24 
 
 		 1245 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  26.23 
 
 		 911 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  38.17 
 
 		 969 aa  88.2  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  27.07 
 
 		 896 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  27.8 
 
 		 826 aa  86.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  29.48 
 
 		 931 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  27.63 
 
 		 681 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  28.35 
 
 		 822 aa  85.1  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.21 
 
 		 806 aa  84  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  30.68 
 
 		 692 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  28.29 
 
 		 683 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  25.56 
 
 		 912 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  26.89 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  24.3 
 
 		 744 aa  71.2  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.93 
 
 		 731 aa  67.8  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  31.93 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  32.81 
 
 		 595 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  30.09 
 
 		 948 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.54 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  24.71 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  24.91 
 
 		 737 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  46.15 
 
 		 947 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  38.46 
 
 		 472 aa  54.7  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3369  peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 		 598 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  36.71 
 
 		 1135 aa  45.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>