70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1701 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  100 
 
 		 1041 aa  2068    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  39.39 
 
 		 828 aa  373  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  33.81 
 
 		 877 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  38.69 
 
 		 952 aa  228  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  35.16 
 
 		 889 aa  194  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  34.81 
 
 		 959 aa  188  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  35 
 
 		 918 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  34.74 
 
 		 885 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  33.92 
 
 		 938 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  28.16 
 
 		 1245 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  27.23 
 
 		 819 aa  169  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.94 
 
 		 914 aa  169  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  35.69 
 
 		 870 aa  167  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  34.59 
 
 		 279 aa  161  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  27.8 
 
 		 896 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  32.2 
 
 		 927 aa  155  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  31.23 
 
 		 924 aa  153  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  28 
 
 		 946 aa  147  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  42.78 
 
 		 962 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  40.84 
 
 		 968 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  41.05 
 
 		 969 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  53.08 
 
 		 1027 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  28.43 
 
 		 1057 aa  138  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 		 911 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 		 911 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  37.89 
 
 		 673 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  40.84 
 
 		 933 aa  133  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  40.53 
 
 		 940 aa  131  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  28.95 
 
 		 931 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  29.02 
 
 		 897 aa  128  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 		 912 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  30.05 
 
 		 658 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  26.96 
 
 		 888 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  29.2 
 
 		 883 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  28.29 
 
 		 640 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  46.73 
 
 		 883 aa  115  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  31.13 
 
 		 679 aa  114  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  43.28 
 
 		 964 aa  113  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  26.98 
 
 		 822 aa  108  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  42.11 
 
 		 870 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  30.29 
 
 		 806 aa  101  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  29.85 
 
 		 826 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  32.42 
 
 		 717 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  30.32 
 
 		 681 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  30.98 
 
 		 737 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  29.41 
 
 		 683 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  38.6 
 
 		 948 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  39.82 
 
 		 595 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.2 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  36.84 
 
 		 947 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  27.27 
 
 		 715 aa  77.4  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  28.88 
 
 		 731 aa  76.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  29.18 
 
 		 722 aa  75.5  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.59 
 
 		 472 aa  70.5  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  29.56 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  21.05 
 
 		 744 aa  67.4  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1036 aa  55.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  32.91 
 
 		 957 aa  50.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  29.17 
 
 		 633 aa  49.7  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  31.68 
 
 		 1247 aa  49.3  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  43.4 
 
 		 692 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  55 
 
 		 1359 aa  48.5  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 937 aa  48.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  47.83 
 
 		 895 aa  47  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  26.71 
 
 		 945 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  44.68 
 
 		 1408 aa  45.8  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  33.67 
 
 		 445 aa  45.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1135 aa  45.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  33.33 
 
 		 1454 aa  45.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  31.03 
 
 		 1761 aa  44.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>