62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1490 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  64.25 
 
 		 1097 aa  1162    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  100 
 
 		 1124 aa  2180    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  89.85 
 
 		 1115 aa  1707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  94.35 
 
 		 1129 aa  1809    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  59.19 
 
 		 1147 aa  1097    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  59.69 
 
 		 1143 aa  1098    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  59.16 
 
 		 1149 aa  1093    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  73.65 
 
 		 1110 aa  1372    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  59.06 
 
 		 1148 aa  1090    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  41.92 
 
 		 945 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  40.23 
 
 		 1408 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  43.51 
 
 		 937 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  42.37 
 
 		 895 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  39.19 
 
 		 1761 aa  337  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  40.75 
 
 		 957 aa  334  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  65 
 
 		 1135 aa  181  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1482 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  29.05 
 
 		 1454 aa  99  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  26.67 
 
 		 1359 aa  94  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1273 aa  91.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  24.7 
 
 		 1247 aa  82.4  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  56.9 
 
 		 1057 aa  79.7  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1621 aa  78.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  26.48 
 
 		 822 aa  74.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  23.59 
 
 		 897 aa  67.4  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  21.09 
 
 		 336 aa  67.4  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  22.64 
 
 		 888 aa  67  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  27.78 
 
 		 927 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  27.89 
 
 		 806 aa  66.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  28.09 
 
 		 883 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  26.92 
 
 		 896 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  23.62 
 
 		 911 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  23.62 
 
 		 911 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  37.84 
 
 		 384 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  37.84 
 
 		 386 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 391 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  31.65 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.57 
 
 		 931 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  40 
 
 		 323 aa  53.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  40.74 
 
 		 946 aa  52.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  24.19 
 
 		 912 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  31.01 
 
 		 819 aa  52  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  42.31 
 
 		 744 aa  52  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1162 aa  52  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  51.6  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  40 
 
 		 349 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  35.62 
 
 		 345 aa  50.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  40 
 
 		 349 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  32.99 
 
 		 883 aa  48.1  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  42.37 
 
 		 312 aa  47.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  42.37 
 
 		 312 aa  47.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1041 aa  47.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  50 
 
 		 914 aa  47.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  46.51 
 
 		 1245 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  53.49 
 
 		 924 aa  45.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  34.43 
 
 		 300 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 940 aa  45.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.59 
 
 		 731 aa  45.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  35.59 
 
 		 722 aa  45.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  34.43 
 
 		 241 aa  44.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>