34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4371 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1478    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  51.82 
 
 		 890 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  42.91 
 
 		 802 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  47.8 
 
 		 708 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  47.8 
 
 		 708 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  47.8 
 
 		 710 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  46.82 
 
 		 694 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  45.56 
 
 		 685 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  64.63 
 
 		 752 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  61.63 
 
 		 844 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  61.63 
 
 		 875 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  61.63 
 
 		 875 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  61.63 
 
 		 875 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  61.63 
 
 		 882 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  61.63 
 
 		 881 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  61.63 
 
 		 190 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  69.23 
 
 		 882 aa  101  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  65 
 
 		 881 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  42.62 
 
 		 673 aa  54.3  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  43.33 
 
 		 969 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  43.33 
 
 		 962 aa  52.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  53.33 
 
 		 952 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1036 aa  49.3  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  40.26 
 
 		 828 aa  48.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  38.6 
 
 		 940 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  39.19 
 
 		 911 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  39.19 
 
 		 912 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  47.73 
 
 		 948 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  39.19 
 
 		 911 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  47.73 
 
 		 947 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  38.89 
 
 		 658 aa  44.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  53.33 
 
 		 924 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 883 aa  44.3  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  53.33 
 
 		 927 aa  44.3  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>