26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1405 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 604 aa  1206    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  86.42 
 
 		 601 aa  1032    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 896 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  26.78 
 
 		 911 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  27.05 
 
 		 912 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 		 911 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  37.5 
 
 		 1057 aa  57.4  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  30.2 
 
 		 948 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  27.27 
 
 		 931 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  27.23 
 
 		 947 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  27.7 
 
 		 924 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  29.86 
 
 		 927 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  24.77 
 
 		 914 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  25.37 
 
 		 883 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  27.14 
 
 		 946 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  27.13 
 
 		 959 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  35.09 
 
 		 681 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  35.64 
 
 		 938 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  27.97 
 
 		 889 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  37.5 
 
 		 1245 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1036 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  35.44 
 
 		 826 aa  45.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  33.73 
 
 		 715 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  33.75 
 
 		 945 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1482 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  43.9  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>