68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1074 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  100 
 
 		 1273 aa  2422    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  35.72 
 
 		 1482 aa  318  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  32.9 
 
 		 1621 aa  245  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  40.12 
 
 		 1454 aa  112  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  26.75 
 
 		 945 aa  109  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  29.39 
 
 		 1359 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  27.33 
 
 		 937 aa  106  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  25.67 
 
 		 1408 aa  103  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1097 aa  93.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  26.8 
 
 		 957 aa  94  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1162 aa  92.8  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1147 aa  90.1  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1143 aa  89.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1148 aa  89.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1149 aa  88.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1124 aa  88.2  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1129 aa  88.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  41.18 
 
 		 1245 aa  87.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1115 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  27.37 
 
 		 1761 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  25.86 
 
 		 1247 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  33.06 
 
 		 1057 aa  79.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1135 aa  79  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  25.64 
 
 		 895 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  28.24 
 
 		 888 aa  77  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  25.45 
 
 		 897 aa  72.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.13 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  29.87 
 
 		 946 aa  70.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.23 
 
 		 336 aa  70.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  29.61 
 
 		 948 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1110 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  31.87 
 
 		 822 aa  68.9  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  26.64 
 
 		 911 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  26.23 
 
 		 911 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  29.05 
 
 		 947 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  29.12 
 
 		 931 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  26.02 
 
 		 896 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  26.98 
 
 		 883 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.68 
 
 		 914 aa  63.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  24.8 
 
 		 912 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  27.35 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  24.41 
 
 		 927 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  22.34 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  50.91 
 
 		 968 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  36.71 
 
 		 744 aa  57.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  50.91 
 
 		 969 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  50 
 
 		 962 aa  54.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  42.37 
 
 		 386 aa  53.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  42.37 
 
 		 384 aa  53.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 391 aa  51.6  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  27.91 
 
 		 722 aa  51.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  37.14 
 
 		 241 aa  51.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  27.91 
 
 		 731 aa  51.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  36.76 
 
 		 681 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  29.52 
 
 		 1027 aa  50.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  28.46 
 
 		 883 aa  49.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  35.21 
 
 		 870 aa  48.9  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  35.94 
 
 		 242 aa  48.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  40.62 
 
 		 392 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  35.44 
 
 		 345 aa  48.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  34.52 
 
 		 364 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  34.52 
 
 		 364 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  30.22 
 
 		 307 aa  47.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  36.36 
 
 		 411 aa  46.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  32 
 
 		 349 aa  45.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  32 
 
 		 349 aa  45.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  34.62 
 
 		 300 aa  45.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  30.43 
 
 		 279 aa  45.1  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>