71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3804 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  100 
 
 		 1162 aa  2216    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  34.33 
 
 		 1359 aa  149  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  27.39 
 
 		 945 aa  147  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  28.82 
 
 		 937 aa  129  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1135 aa  128  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  30.56 
 
 		 1247 aa  125  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  28.38 
 
 		 957 aa  122  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  31.85 
 
 		 895 aa  115  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1097 aa  112  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  25 
 
 		 1482 aa  108  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  25.73 
 
 		 1408 aa  108  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1147 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1148 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1143 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1149 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  33.87 
 
 		 1761 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1273 aa  101  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  25.94 
 
 		 1454 aa  100  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1124 aa  99  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1129 aa  99  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1115 aa  94.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  41.24 
 
 		 1110 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1621 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  35.58 
 
 		 1057 aa  80.9  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  37.36 
 
 		 1245 aa  79  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.09 
 
 		 323 aa  73.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  37.62 
 
 		 924 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  38.27 
 
 		 822 aa  72.8  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  26.2 
 
 		 927 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  33.71 
 
 		 914 aa  69.7  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  38.27 
 
 		 888 aa  69.3  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.62 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  37.84 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  35.96 
 
 		 946 aa  65.1  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  34.62 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  35.9 
 
 		 948 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  35.8 
 
 		 883 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  35.9 
 
 		 947 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 911 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  33.65 
 
 		 896 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  35.8 
 
 		 931 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 911 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  40.48 
 
 		 828 aa  56.2  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  23.43 
 
 		 897 aa  56.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  27.97 
 
 		 870 aa  55.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  24.63 
 
 		 912 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  45.45 
 
 		 683 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  31.03 
 
 		 731 aa  52.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  31.03 
 
 		 722 aa  53.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  24.26 
 
 		 819 aa  51.6  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  27.19 
 
 		 640 aa  51.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  43.14 
 
 		 681 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  27.19 
 
 		 640 aa  50.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  42.86 
 
 		 411 aa  50.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  40 
 
 		 962 aa  49.7  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  40 
 
 		 969 aa  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  40 
 
 		 968 aa  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  28 
 
 		 658 aa  50.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  43.14 
 
 		 384 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  43.14 
 
 		 386 aa  50.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 940 aa  48.9  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 391 aa  48.5  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  31.82 
 
 		 279 aa  48.5  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  28.97 
 
 		 883 aa  48.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  31.33 
 
 		 826 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1036 aa  46.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  38.89 
 
 		 715 aa  45.8  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  36.96 
 
 		 952 aa  45.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  34.21 
 
 		 885 aa  45.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  34.21 
 
 		 918 aa  45.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>