47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3759 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  30.12 
 
 		 364 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  29.9 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  30.02 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  29.57 
 
 		 349 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  31.85 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  34.01 
 
 		 241 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3760  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.693431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0380  hypothetical protein  33.06 
 
 		 258 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  31.84 
 
 		 242 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0535  hypothetical protein  29.32 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1861  hypothetical protein  31.02 
 
 		 217 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2113  hypothetical protein  31.02 
 
 		 217 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.674984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4425  hypothetical protein  30.26 
 
 		 239 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0306  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  96.3  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  33.77 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  43.75 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  43.75 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  43.75 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  43.84 
 
 		 1359 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  33.07 
 
 		 1247 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1162 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  28 
 
 		 1621 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30.71 
 
 		 744 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  35 
 
 		 1097 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  39.66 
 
 		 914 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1482 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1273 aa  46.6  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  41.38 
 
 		 946 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  43.1 
 
 		 924 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  38.6 
 
 		 895 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1148 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  34.57 
 
 		 1245 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  41.51 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1149 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  35 
 
 		 1110 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1143 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  43.86 
 
 		 927 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  35 
 
 		 1115 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  35 
 
 		 1124 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  35 
 
 		 1129 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1147 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  31.62 
 
 		 1454 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  39.62 
 
 		 1057 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  38.6 
 
 		 945 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 883 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>