22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0306 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2113  hypothetical protein  45.02 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.674984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1861  hypothetical protein  45.78 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  38.72 
 
 		 241 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0535  hypothetical protein  36.15 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0380  hypothetical protein  32.92 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4425  hypothetical protein  33.19 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  33.89 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3760  hypothetical protein  31.97 
 
 		 278 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.693431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  28.83 
 
 		 307 aa  111  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 391 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  42.73 
 
 		 386 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  42.73 
 
 		 384 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  42.74 
 
 		 364 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  29.26 
 
 		 411 aa  95.5  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  42.74 
 
 		 349 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  45.45 
 
 		 345 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  36.81 
 
 		 364 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  43.14 
 
 		 349 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  44.07 
 
 		 1359 aa  48.5  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1273 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>