53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0446 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  41.01 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0535  hypothetical protein  40.45 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4425  hypothetical protein  42.06 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0380  hypothetical protein  44.77 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  39.67 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0306  hypothetical protein  38.72 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  32.97 
 
 		 307 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1861  hypothetical protein  36.32 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2113  hypothetical protein  35.9 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.674984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3760  hypothetical protein  34.69 
 
 		 278 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.693431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  33.05 
 
 		 411 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  42.6 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  49.62 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  49.24 
 
 		 364 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  54.21 
 
 		 364 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  45.03 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  56.99 
 
 		 386 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 391 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  55.91 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  36.84 
 
 		 1359 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1273 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  45.16 
 
 		 472 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  36.67 
 
 		 1761 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  43.55 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  33.87 
 
 		 945 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  36.36 
 
 		 1408 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1110 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1135 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1147 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1149 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1143 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1148 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  32 
 
 		 918 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1115 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1124 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1097 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1129 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  34.92 
 
 		 957 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1162 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1482 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  42.31 
 
 		 822 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  31.88 
 
 		 937 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  28.57 
 
 		 1247 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  36.67 
 
 		 914 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  31.31 
 
 		 885 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  31.67 
 
 		 895 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  39.22 
 
 		 1057 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  30.68 
 
 		 604 aa  42.4  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1621 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 962 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  42.03 
 
 		 802 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  32.93 
 
 		 888 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>