27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3760 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3760  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.693431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  35.35 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  33.44 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  34.69 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  34.62 
 
 		 411 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  30.68 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0535  hypothetical protein  33.2 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0306  hypothetical protein  31.97 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1861  hypothetical protein  28.79 
 
 		 217 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  27.83 
 
 		 345 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4425  hypothetical protein  29 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2113  hypothetical protein  29.63 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.674984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  35.62 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  46 
 
 		 349 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  46 
 
 		 349 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  55.56 
 
 		 384 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  54.32 
 
 		 386 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  46 
 
 		 364 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 391 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  44.07 
 
 		 1359 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  37.74 
 
 		 1247 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  33.77 
 
 		 1408 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  35.59 
 
 		 1761 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1621 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  30.77 
 
 		 937 aa  42  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  34.85 
 
 		 1162 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>