76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1485 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1485  ATPase  100 
 
 		 1761 aa  3302    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  39.96 
 
 		 1408 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  37.71 
 
 		 1148 aa  348  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  39.06 
 
 		 1149 aa  348  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  37.6 
 
 		 1143 aa  346  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  38.72 
 
 		 1147 aa  343  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1124 aa  342  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  37.34 
 
 		 945 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1135 aa  338  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  38.74 
 
 		 1097 aa  337  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  38.8 
 
 		 1129 aa  333  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1115 aa  326  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1110 aa  324  9.000000000000001e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  35.88 
 
 		 957 aa  308  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  37.38 
 
 		 937 aa  299  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  41.7 
 
 		 895 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  30.23 
 
 		 1359 aa  119  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1482 aa  112  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1162 aa  104  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  27.68 
 
 		 1454 aa  98.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  37.69 
 
 		 1247 aa  98.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1621 aa  90.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  28.02 
 
 		 602 aa  89.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  41.67 
 
 		 1057 aa  85.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1273 aa  80.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  32.39 
 
 		 423 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.44 
 
 		 1240 aa  75.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  38.62 
 
 		 926 aa  69.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  30.77 
 
 		 822 aa  69.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  36.78 
 
 		 1245 aa  67.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.65 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  30.22 
 
 		 617 aa  64.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  36.78 
 
 		 914 aa  63.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  43.33 
 
 		 888 aa  63.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  47.44 
 
 		 1261 aa  62.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  42.37 
 
 		 386 aa  62  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  42.37 
 
 		 384 aa  61.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  35.11 
 
 		 897 aa  61.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  23.92 
 
 		 336 aa  60.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf584  virulence-associated lipoprotein MIA  29.03 
 
 		 255 aa  58.5  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0652484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  37.88 
 
 		 819 aa  58.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  45.76 
 
 		 924 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  35.16 
 
 		 947 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  45.76 
 
 		 927 aa  57  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  36.84 
 
 		 828 aa  57  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  41.89 
 
 		 948 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  39.66 
 
 		 323 aa  55.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  40.98 
 
 		 946 aa  55.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  36.48 
 
 		 718 aa  54.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  36.23 
 
 		 364 aa  54.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  42.19 
 
 		 896 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  36.23 
 
 		 349 aa  54.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  32.29 
 
 		 5185 aa  54.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  36.23 
 
 		 364 aa  53.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  36.23 
 
 		 349 aa  54.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  27.07 
 
 		 883 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  37.88 
 
 		 744 aa  53.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  25.56 
 
 		 911 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  27.85 
 
 		 630 aa  53.5  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  25.56 
 
 		 911 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  33.54 
 
 		 941 aa  52.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  39.34 
 
 		 300 aa  52  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  43.86 
 
 		 931 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  37.29 
 
 		 345 aa  51.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  38.57 
 
 		 883 aa  50.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  43.4 
 
 		 870 aa  51.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  24.83 
 
 		 9529 aa  50.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.86 
 
 		 491 aa  50.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0111  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1165 aa  49.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2425  hypothetical protein  27.43 
 
 		 326 aa  47.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  38.1 
 
 		 889 aa  46.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  24.36 
 
 		 609 aa  46.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  38.1 
 
 		 991 aa  45.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  35.53 
 
 		 940 aa  45.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>