50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1992 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  100 
 
 		 336 aa  675    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  75.85 
 
 		 323 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1482 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  27.47 
 
 		 1245 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  24.53 
 
 		 1454 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  45 
 
 		 1621 aa  77  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1148 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1143 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1149 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1147 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1273 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1129 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1124 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  23.68 
 
 		 945 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1162 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  20.22 
 
 		 1115 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  34.38 
 
 		 822 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  38.67 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  31.82 
 
 		 1057 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  23.92 
 
 		 1761 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  31.25 
 
 		 957 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  27.62 
 
 		 914 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  25.11 
 
 		 1359 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  30.67 
 
 		 895 aa  60.1  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  26.09 
 
 		 946 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  35 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1135 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1097 aa  56.6  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  32.89 
 
 		 1247 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  27.55 
 
 		 888 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1110 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  23.28 
 
 		 927 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  29.11 
 
 		 1408 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  25.35 
 
 		 819 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  22.41 
 
 		 924 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  22.27 
 
 		 911 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  21.86 
 
 		 911 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  36.23 
 
 		 744 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  35.29 
 
 		 948 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  29.69 
 
 		 931 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  22.17 
 
 		 883 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  35.29 
 
 		 947 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  33.82 
 
 		 962 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  33.82 
 
 		 968 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  33.82 
 
 		 969 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  23.08 
 
 		 640 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  23.08 
 
 		 640 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  33.93 
 
 		 940 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  32.76 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  31.88 
 
 		 952 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>