57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0497 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  90.93 
 
 
364 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  86.81 
 
 
364 aa  634    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  95.13 
 
 
349 aa  670    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  48.73 
 
 
300 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  46.04 
 
 
386 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  43.07 
 
 
391 aa  285  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  45.24 
 
 
384 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  44.66 
 
 
345 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  34.64 
 
 
307 aa  155  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  29.38 
 
 
411 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4425  hypothetical protein  45.76 
 
 
239 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  42.6 
 
 
241 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0535  hypothetical protein  42.37 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  39.23 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0380  hypothetical protein  35.22 
 
 
258 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0306  hypothetical protein  43.14 
 
 
232 aa  93.2  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3760  hypothetical protein  46 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.693431  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1861  hypothetical protein  30.99 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2113  hypothetical protein  40.96 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.674984  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  46.15 
 
 
1247 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  42.11 
 
 
895 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  47.46 
 
 
1359 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  36.23 
 
 
1761 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  41.43 
 
 
822 aa  53.1  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  40.35 
 
 
1135 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  42.11 
 
 
945 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  37.78 
 
 
927 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  36.73 
 
 
924 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  41.82 
 
 
1097 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  45.45 
 
 
937 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  40 
 
 
1115 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  40 
 
 
1110 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  40 
 
 
1129 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  40 
 
 
1124 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  37.78 
 
 
806 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  41.82 
 
 
1147 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  41.82 
 
 
1148 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  41.82 
 
 
1143 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  41.82 
 
 
1149 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  38.98 
 
 
957 aa  49.7  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  33.33 
 
 
1245 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  39.44 
 
 
826 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  44.23 
 
 
914 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  39.73 
 
 
1482 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  45.28 
 
 
870 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  45.1 
 
 
1162 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  39.06 
 
 
931 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  32 
 
 
1273 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  41.07 
 
 
1408 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  45.28 
 
 
1057 aa  46.2  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  36.99 
 
 
1454 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  40.32 
 
 
744 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  37.68 
 
 
952 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  39.62 
 
 
1621 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  39.44 
 
 
658 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  34.67 
 
 
1036 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>