25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0676 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  100 
 
 
844 aa  1584    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  62.94 
 
 
875 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  62.94 
 
 
875 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  62.94 
 
 
875 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  42.31 
 
 
694 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  51.94 
 
 
802 aa  188  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  41.32 
 
 
685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  46.08 
 
 
708 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  46.08 
 
 
708 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  98.84 
 
 
190 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  88.6 
 
 
882 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  89.47 
 
 
881 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  89.47 
 
 
881 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  49.2 
 
 
783 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  73.49 
 
 
752 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  70.48 
 
 
710 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  65.12 
 
 
890 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  65.43 
 
 
882 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
952 aa  47.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  36.08 
 
 
1036 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
940 aa  47  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  40.91 
 
 
673 aa  45.8  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  34.31 
 
 
959 aa  44.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  51.16 
 
 
731 aa  44.3  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  51.16 
 
 
722 aa  44.3  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>