20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2310 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  98.41 
 
 
881 aa  1585    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  97.73 
 
 
875 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  100 
 
 
881 aa  1613    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  97.14 
 
 
882 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  97.73 
 
 
875 aa  993    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  97.73 
 
 
875 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  62.59 
 
 
844 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  98.42 
 
 
190 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  49.37 
 
 
802 aa  201  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  52.7 
 
 
708 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  52.7 
 
 
708 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  47.6 
 
 
710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  45.45 
 
 
783 aa  147  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  77.91 
 
 
694 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  76.74 
 
 
685 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  73.49 
 
 
752 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  75 
 
 
890 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  70 
 
 
882 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
952 aa  47.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
940 aa  47  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.343292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>