21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1855 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  96.59 
 
 
881 aa  953    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  1606    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  96.94 
 
 
881 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  97.14 
 
 
882 aa  777    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  1606    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  1606    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  62.41 
 
 
844 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  41 
 
 
694 aa  204  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  49.68 
 
 
802 aa  197  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  41.56 
 
 
685 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  51.79 
 
 
708 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  51.79 
 
 
708 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  45.08 
 
 
783 aa  140  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  60.98 
 
 
710 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  73.49 
 
 
752 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  75 
 
 
890 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  70 
 
 
882 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
952 aa  47.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
940 aa  46.2  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  51.16 
 
 
722 aa  44.3  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>