37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1724 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  354  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  98.42 
 
 
881 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  97.89 
 
 
881 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  96.95 
 
 
882 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  98.84 
 
 
844 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  77.91 
 
 
694 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  76.74 
 
 
685 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  74.42 
 
 
802 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  74.42 
 
 
708 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  74.42 
 
 
708 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  74.42 
 
 
710 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  73.49 
 
 
752 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  61.45 
 
 
783 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  65.12 
 
 
890 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  65.43 
 
 
882 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  36.67 
 
 
1036 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
940 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 
952 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  48.94 
 
 
822 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  50 
 
 
731 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  50 
 
 
722 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  41.3 
 
 
819 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  43.18 
 
 
946 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  46.67 
 
 
931 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  41.82 
 
 
870 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  44.44 
 
 
948 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  44.44 
 
 
947 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  48.89 
 
 
883 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
911 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
911 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
912 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  45.45 
 
 
964 aa  41.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
896 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  50 
 
 
806 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>