More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0912 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0942  hypothetical protein  89.12 
 
 
377 aa  700    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0912  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  762    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0416  hypothetical protein  44.32 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0440  hypothetical protein  44.32 
 
 
356 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1099  response regulator receiver domain-containing protein  27.82 
 
 
390 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.076371  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  37.17 
 
 
520 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  37.17 
 
 
520 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  38.14 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0204  diguanylate cyclase  37.68 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209858  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.58 
 
 
353 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  29.76 
 
 
364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  36.81 
 
 
410 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  36.17 
 
 
522 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  39.2 
 
 
564 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.08 
 
 
337 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  36.07 
 
 
516 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  33.18 
 
 
342 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.55 
 
 
355 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2194  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.9 
 
 
636 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0610  two component response regulator  38.42 
 
 
649 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0619  response regulator receiver protein  31.62 
 
 
378 aa  123  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  40.31 
 
 
501 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  34.33 
 
 
629 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  38.67 
 
 
620 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  42.53 
 
 
1034 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  32.26 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.5 
 
 
1262 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1511  diguanylate cyclase  35.07 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00199134  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  32.26 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.31 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3384  diguanylate cyclase  35.43 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32659  normal  0.816188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  32.26 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  25.79 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0251  diguanylate cyclase  34.55 
 
 
660 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696506  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  38.55 
 
 
569 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  39.08 
 
 
547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3566  diguanylate cyclase  36.63 
 
 
561 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0665818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  36.09 
 
 
638 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  34.55 
 
 
527 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1887  diguanylate cyclase  35.32 
 
 
327 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.17 
 
 
434 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.23 
 
 
557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  40.22 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3624  diguanylate cyclase  28.81 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.112804  normal  0.505096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  32.02 
 
 
565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  35.94 
 
 
522 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.73 
 
 
322 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.73 
 
 
322 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.71 
 
 
557 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3956  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.98 
 
 
357 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892783  normal  0.485051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  25.75 
 
 
381 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  36.78 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40 
 
 
560 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  35.36 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  34.05 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5041  putative signaling protein  31.67 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.883935  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0930  diguanylate cyclase  30.62 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3449  diguanylate cyclase  36.98 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  37.36 
 
 
893 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.85 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1041  diguanylate cyclase  38.32 
 
 
791 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  33.68 
 
 
508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  35.42 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3010  diguanylate cyclase  27.05 
 
 
377 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0798808  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.72 
 
 
550 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.98 
 
 
345 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  38.29 
 
 
641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  34 
 
 
555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  37.22 
 
 
523 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3853  diguanylate cyclase  29.18 
 
 
359 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  38.17 
 
 
462 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1282  diguanylate cyclase  29.89 
 
 
578 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  35.12 
 
 
518 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2101  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  38.29 
 
 
849 aa  116  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  33.79 
 
 
482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1690  diguanylate cyclase  36.55 
 
 
331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  36.99 
 
 
516 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4015  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35 
 
 
315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  31.56 
 
 
298 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  38.86 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  34.34 
 
 
528 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1211  diguanylate cyclase  29.52 
 
 
578 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1212  diguanylate cyclase  29.62 
 
 
578 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0794  diguanylate cyclase  29.33 
 
 
394 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  37.29 
 
 
522 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0831  diguanylate cyclase  32.22 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0318  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.83 
 
 
612 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36.36 
 
 
624 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  38.17 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  32.13 
 
 
935 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  32.12 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.21 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  33.51 
 
 
497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  33.51 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  32.57 
 
 
492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  32.57 
 
 
492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0754  diguanylate cyclase  30.64 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  34.59 
 
 
533 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  37.14 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.04 
 
 
756 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>