More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3195 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  68.88 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  71.65 
 
 		 200 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  65.46 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 211 aa  255  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  30.96 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  50.94 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.47 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 388 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 470 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 280 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  28.12 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 390 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 251 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  31.3 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>