207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3157 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3157  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  71.82 
 
 
328 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  69.49 
 
 
320 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  69.49 
 
 
326 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  65.24 
 
 
324 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  64.97 
 
 
321 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1186  hypothetical protein  70.64 
 
 
332 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1106  fatty acid hydroxylase  70.95 
 
 
332 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2079  hypothetical protein  62.69 
 
 
324 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.768511  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  53.21 
 
 
331 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  53.47 
 
 
324 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  56.07 
 
 
324 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  54.08 
 
 
324 aa  328  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  52.87 
 
 
324 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  47.09 
 
 
327 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  45.26 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  45.71 
 
 
329 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  45.71 
 
 
329 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  45.71 
 
 
329 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  45.31 
 
 
324 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  45.62 
 
 
324 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  44.69 
 
 
325 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  45.31 
 
 
324 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  45.4 
 
 
329 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  45 
 
 
324 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  45.4 
 
 
329 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  45.4 
 
 
329 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  45.4 
 
 
329 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  44.69 
 
 
324 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  44.69 
 
 
324 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  45.57 
 
 
332 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1258  putative transmembrane protein  39.08 
 
 
323 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.205212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  36.59 
 
 
308 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  36.92 
 
 
324 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  38.44 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  38.77 
 
 
297 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  29.05 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.98 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  30.66 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  28.08 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.13 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  30.57 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  28.66 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  26.99 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  28.21 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  25.27 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  29.59 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  32.12 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  24.78 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  28.24 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  26.29 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  27.44 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  27.62 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  29.03 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  26.11 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  29.48 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  30.39 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.31 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  26.06 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.74 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  27.67 
 
 
380 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  23.48 
 
 
284 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  30.52 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.12 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.32 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  26.07 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  26.32 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.97 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.35 
 
 
278 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.97 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.97 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  24.77 
 
 
385 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  29.09 
 
 
274 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  28.44 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.97 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  27.45 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  25.71 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  26.63 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  24.77 
 
 
401 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  30.91 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  29.01 
 
 
431 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  24.77 
 
 
401 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  27.54 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  28.11 
 
 
597 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  31.08 
 
 
272 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  27.23 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  27.74 
 
 
386 aa  59.7  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  29.06 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 
289 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  33.33 
 
 
322 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  27.57 
 
 
597 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 
431 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  25.44 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  27.86 
 
 
626 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  28.98 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>