196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0468 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 319 aa  633    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  52.57 
 
 		 197 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 202 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  52.94 
 
 		 169 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  46.2 
 
 		 174 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  49.06 
 
 		 159 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  49.06 
 
 		 159 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  49.51 
 
 		 155 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  49.51 
 
 		 159 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  49.04 
 
 		 166 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  49.04 
 
 		 164 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  49.04 
 
 		 148 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  46.15 
 
 		 185 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  43.52 
 
 		 152 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  41.35 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  37.7 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  43.69 
 
 		 151 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  37.61 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 191 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 184 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  40.86 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.57 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 196 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  36.94 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  35.62 
 
 		 107 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  35.64 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.06 
 
 		 152 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  35.4 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  32.56 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 747 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  36.89 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  34.29 
 
 		 162 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  34.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 197 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.06 
 
 		 155 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  40.28 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  28.85 
 
 		 151 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  40.28 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  42.31 
 
 		 190 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  40.28 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 207 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  28.85 
 
 		 151 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 202 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 209 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 216 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 257 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  27.63 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  28.65 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 183 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  42 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 215 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 240 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>