40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2609 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  38.03 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  33.57 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  33.8 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  40.97 
 
 		 185 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  34.06 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  32.62 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  32.62 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 148 aa  94.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  39.58 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  35 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  30.71 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  33.58 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  30.99 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  28.93 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  31.47 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  25.35 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  27.54 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  32.69 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.95 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  26.81 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  21.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  26.28 
 
 		 160 aa  44.3  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  23.13 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  36 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  28.17 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  24.48 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2581  hypothetical protein  29.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  27.72 
 
 		 150 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  23.91 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>