23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1518 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  323  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  79.35 
 
 
159 aa  261  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3328  hypothetical protein  49.66 
 
 
167 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311727  hitchhiker  0.00221745 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  37.5 
 
 
176 aa  103  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  30 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  25.53 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  33.64 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  25.53 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  24.14 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  23.19 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  23.19 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  23.36 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  20.74 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  22.63 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  22.63 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  62.07 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  23.91 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  27.54 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  19.58 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
319 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.02 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>