27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4528 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  318  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  32.59 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  30.5 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  29.87 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  25.53 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  28.89 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  25.35 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  25.37 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  25.37 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
319 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  25.37 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  25.37 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  27.97 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  25.52 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  24.29 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  24.29 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  25.68 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  30.2 
 
 
150 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  26.36 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  26.47 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  23.31 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  27.54 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.92 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  23.13 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  23.31 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  24.11 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>