32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1012 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3328  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311727  hitchhiker  0.00221745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  30.56 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  35.71 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  32.64 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  32.37 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  25.52 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  25.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  25.78 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  26.81 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  25.37 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  31.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  25.37 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  35.48 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  24.11 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  24.11 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  24 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  24.63 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  24.63 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  47.22 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.72 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 319 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  25 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2226  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  hitchhiker  0.0072885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  25.6 
 
 		 138 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>