32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1397 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  29.86 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  34.48 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  30.34 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  27.08 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.39 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  32.64 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  32.64 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  32.64 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  32.64 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  33.09 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  30.07 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  32.47 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  31.72 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  30.5 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  30.67 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  32.17 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  27.54 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  30 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  26.87 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
319 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  31.75 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  25.78 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  23.45 
 
 
147 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  26.67 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  20.74 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  29.66 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  28.4 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  24.34 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  25.37 
 
 
146 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>