40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0060 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  47.37 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  46.1 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  48.59 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  40.69 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  40.14 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  40.56 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  40.56 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  41.43 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  42.65 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  42.75 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  40.97 
 
 		 162 aa  98.2  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 319 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.87 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  34.29 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  33.12 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  52.5 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  30.5 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  30.22 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  28.77 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  24.65 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  24.65 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  23.24 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  35.25 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  32.14 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1118  hypothetical protein  31.78 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392266  normal  0.775853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  25.55 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  27.54 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  30.56 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  33.77 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  26.95 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0473  hypothetical protein  23.61 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0246193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>