39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2018 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  92.05 
 
 		 151 aa  288  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  29.86 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  27.59 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  31.21 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  27.46 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  27.46 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  26.9 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  26.9 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  29.1 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  27.54 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  30.15 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  25.18 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  25.9 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  27.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  25.41 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  24.44 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  33.75 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  25.53 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 319 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  26.21 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  24 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  31.51 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  21.43 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  23.31 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  24.05 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.66 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  25.93 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26.43 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  23.68 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  23.68 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  23.68 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2581  hypothetical protein  25.68 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>