35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4393 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  37.04 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  40 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  38.64 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  33.58 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  32.12 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  32.12 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  32.12 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  32.12 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  31.34 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  37.41 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  32.39 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  33.63 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  33.82 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  28.37 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.22 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  32.64 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  27.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  27.41 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  35.48 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  24.52 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  33.93 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  33 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  37.76 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  41.43 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  32.52 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  37.76 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  52.63 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>