39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3170 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  323  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  99.35 
 
 		 159 aa  322  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  94.81 
 
 		 159 aa  308  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  94.81 
 
 		 159 aa  308  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  95 
 
 		 166 aa  279  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  95 
 
 		 164 aa  279  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  47.55 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  43.8 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  49.51 
 
 		 319 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  43.88 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  42.65 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  34.06 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  32.86 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  41.82 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  32.09 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  27.86 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  27.86 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32156  predicted protein  32.89 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0990853  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  30.88 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  31.43 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  31.34 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  31.16 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  35.46 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.06 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  30.88 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  25.37 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2368  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5489  hypothetical protein  23.36 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  24.63 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1518  hypothetical protein  23.36 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  26.06 
 
 		 168 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  26.13 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  27.27 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>