31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1383 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  100 
 
 		 144 aa  291  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.77 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  29.5 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  30.5 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  30.5 
 
 		 164 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  30.5 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  30.5 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  30.5 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  35.25 
 
 		 174 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  34.91 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  31.47 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  25.9 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  30.22 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  25.18 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  32.37 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  32.64 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  29.79 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 319 aa  53.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  28.03 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  28.37 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  26.57 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  32.46 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  30.23 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  37.35 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  28.89 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  25 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  26.62 
 
 		 161 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>