35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1464 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  35.77 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  35.46 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  37.06 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  32.87 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  32.39 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  30.67 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  31.21 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  30.41 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  30.41 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  30.71 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  28.37 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  33.09 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  28.24 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 
319 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  27.52 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  29.25 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  32.39 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  26.95 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  31.72 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  25.17 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  24.79 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  21.77 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  30.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  21.43 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  26.92 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  26.72 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  27.46 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  25.68 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  40.38 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  34.15 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  26.85 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>