32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2976 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  42.14 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  42.03 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6684  hypothetical protein  35.76 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.919976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4620  hypothetical protein  40.23 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  35.21 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  35.21 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  35.21 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  29.25 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1179  hypothetical protein  27.88 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  33.94 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  28.37 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  30.39 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  34.26 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  31.91 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2987  hypothetical protein  32.1 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  29.73 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  32.39 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  31.21 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1118  hypothetical protein  30.85 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392266  normal  0.775853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7124  hypothetical protein  30.53 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 144 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1545  Polyketide cyclase/dehydrase  32.35 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  32.35 
 
 		 132 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  31.76 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  39.53 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>