11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2987 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2987  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  53.47 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1788  hypothetical protein  50.34 
 
 
156 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1179  hypothetical protein  46.98 
 
 
164 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2330  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0431601  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2688  hypothetical protein  25.95 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0154843  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  32.1 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2446  hypothetical protein  24.66 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2556  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4200  hypothetical protein  26.87 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0571249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0811  hypothetical protein  24.07 
 
 
146 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>