13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2446 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2446  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2556  cyclase/dehydrase  59.86 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2330  cyclase/dehydrase  54.86 
 
 		 144 aa  177  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0431601  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2341  hypothetical protein  47.14 
 
 		 77 aa  72  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  28 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2898  hypothetical protein  26.9 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0123  Polyketide cyclase/dehydrase  24.14 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2987  hypothetical protein  24.66 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1179  hypothetical protein  26.23 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3879  hypothetical protein  25.17 
 
 		 148 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3666  hypothetical protein  30.14 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2688  hypothetical protein  23.2 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0154843  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0811  hypothetical protein  24.75 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>