12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2688 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2688  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  290  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0154843  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0132  CdfA  49.3 
 
 
146 aa  153  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0123  Polyketide cyclase/dehydrase  43.97 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0145  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.14 
 
 
148 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0748499  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3265  hypothetical protein  31.71 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0414  hypothetical protein  30.4 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2330  cyclase/dehydrase  25.6 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0431601  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2987  hypothetical protein  25.95 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2898  hypothetical protein  27.66 
 
 
149 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  26.97 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  27.03 
 
 
371 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2446  hypothetical protein  23.2 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>